什麼是商店？
在商店中可以購買Jala、使用Jala購買道具、購買Ninjala通行證，
各項商品陣容將會以一定期間進行輪替。
連接網路時才可使用。
商店首頁
【Jala商店】
可以透過這裡進入Nintendo eShop購買Jala。
【忍者商店】
可以在這裡購買最佳推薦的道具與暢銷排行榜的道具。
【泡泡糖轉蛋】
可以購買商品陣容中有忍者泡泡糖或特殊道具的泡泡糖轉蛋。
【Ninjala通行證】
可以根據遊戲進度獲得獎勵。
Jala商店
可以透過Jala商店前往Nintendo eShop購買Jala。
組合商品
是以Jala與道具為組合的絕佳商品。
可以透過Jala商店前往Nintendo eShop購買，
從Nintendo eShop的購買畫面返回遊戲時，即可獲得購買的Jala與道具。
忍者商店
可以使用Jala購買套裝、飾品類的裝飾道具、釣竿、魚餌泡泡糖以及假餌等。
除了最佳推薦、排行榜及釣魚裝備外，還會販售聯名限定道具。
可將多項道具放入購物車內，全部進行購買。
若有購買Ninjala通行證、迷你Ninjala通行證，將能享有道具打折優惠（聯名商品除外）。
此外，可購買的道具用途僅為更改外觀，並不會在戰鬥時附加性能。
最佳推薦
最佳推薦的商品每經過一段時間就會更新。
排行榜
將至今於賽季中販售的道具按照銷售額排列，並能查看暢銷商品。
不只能查看暢銷商品，也能購買榜上陳列的所有道具。
此外，部分限定道具不會列入排行榜中，也無法進行購買。
泡泡糖轉蛋
有消耗「Jala」或「金勛章」可進行的轉蛋，也有消耗「轉蛋硬幣」或「銀勛章」可進行的轉蛋。
可以從泡泡糖轉蛋中獲得忍者泡泡糖或是特殊道具，
如果已經獲得特殊道具，泡泡糖轉蛋將只會釋出忍者泡泡糖。
購買層級
可以購買用於推進層級的道具，
在Ninjala通行證的購買畫面中即可使用Jala購買。
購買時可以自由選擇想要推進多少層級，
以購買層級的方式推進層級，或是以累積層級點數的方式推進層級，兩者間並無任何差異。